L'Aeroporto di Naxos è l'aeroporto nazionale dell'isola greca di Naxos. L'aeroporto si trova a circa 3 chilometri dal capoluogo. E' attivo dal 1992 e collega l'isola ad Atene, non ricevendo voli internazionali nè voli charter. Autobus locali collegano con frequenza il centro città (Chora) con l'aeroporto, oltre ai taxi; il tragitto dura circa 10 minuti. L'aeroporto è servito principalmente dalla Olympic Airlines, principale compagnia aerea di bandiera con base in Atene.